Os agricultores familiares buscam através da diversificação da produção uma alternativa sustentável para minimizar os problemas causados pela falta de visibilidade e apoio. Nesse sentido, este trabalho busca analisar um estabelecimento agrícola na região do Baixo Tocantins, utilizando a modelização de fluxos para compreender as relações complexas e dinâmicas presentes no agroecossistema. Através do levantamento de informações e da análise qualitativa, foi possível identificar que o agroecossistema é auto-organizativo e possui relações claras entre os subsistemas, gerando insumos e produtos. A modelização se mostrou fundamental para a compreensão dessas relações e para a gestão do agroecossistema.